1º Usando o terminal
2º Usando um software chamado bleachbit
Vamos lá?
1º No terminal use os comandos
sudo du -sh /var/cache/apt
sudo apt clean
sudo apt autoclean
du -sh ~/.cache/thumbnails
2º Software bleachbit
Use o comando : sudo apt-get install bleachbit
Pronto
Lembrando também que você pode usar a loja de aplicativos para instalar.